L'étude de l'interaction de l'enzyme avec quelques flavonoïdes par modélisation moléculaire

Abstract

Le traitement du diabète de type II sans aucun effet secondaire est toujours un défi pour le système médical. Il en résulte une demande croissante de produits naturels ayant une activité antidiabétique avec moins d'effets secondaires. Certains flavonoïdes ont été signalés dans la littérature comme ayant un potentiel antidiabétique de type 2. L'objectif principal de notre travail est l'étude de l'inhibition des enzymes α-amylase et α-glucosidase par quelques flavonoïdes en utilisant le docking moléculaire en cherchant les orientations dans l’espace et les conformations favorables pour la fixation d’un ligand à un récepteur et déduire le meilleur inhibiteur afin de déterminer la forme la plus active. Beicalein, Apigenin-7-O-Glucuronide, Isocarthymidine, Apigenin, Baicaline ont été pris comme ligands. Les cibles moléculaires (α-amylase salivaire et pancréatique et α-glucosidase) dont les structures cristallographiques sont disponibles dans la base de données PDB sous les noms respectifs de 3L4T, 3OLI et 1Z32 ont été utilisées pour le docking à l'aide de programme MOE. On a constaté que le Beicalein et l'Apigenin obéissent bien la règle 5 de Lipinski ce qui est confirmé par les IC50 tirées de la littérature. Le Beicalein et l'Apigenin sont de bons inhibiteurs de l’α-amylase et l'α- glucosidase