culs de surfaces de l’énergie d’interactions entre le chromophore de la protéine fluorescente (YFP) et la tyrosine. Présentée par : KHEDIM Yasmina épouse RAHMOUN Soutenu le : 21 /06 / 2017 devant la commission d’examen : Pr. Lamia Bedjaoui Présidente UAB Tlemcen Dr. Houria Harek Examinatrice UAB Tlemcen Dr. Sihem Azizi Encadreur UAB Tlemcen Année Universitaire 2016 -2017 Calculs de surfaces de l’énergie d’interactions entre le chromophore de la protéine fluorescente (YFP) et la tyrosine

Abstract

Le cadre général de ce mémoire est une étude théorique par chimie quantique visant à trouver la meilleure méthode pour calculer l'énergie d'interactions entre un chromophore et la tyrosine à l'intérieur d'une protéine fluorescente: la YFP. Il y a plus de 50 ans, la protéine fluorescente verte (GFP) était découverte dans la méduse Aequorea Victoria, elle a commencé à recueillir beaucoup d'attention après son clonage en 1992. Le rôle biologique des protéines fluorescentes n'est pas encore bien déterminé. Elles peuvent être impliquées dans la photosynthèse, la photoréception, ou une protection contre la lumière du soleil pour l'organisme porteur. L'étude théorique des protéines fluorescentes permet de comprendre la dynamique dans les milieux protéiques et ainsi d'améliorer leurs propriétés physico-chimiques en combinant des méthodes de dynamique moléculaire et de chimie quantique. Ce mémoire s'inscrit dans cette optique, il est composé de deux chapitres. Dans le premier chapitre nous présentons les fondements théoriques des calculs de chimie quantique qui sont utilisés pour résoudre l'équation de Schrödinger pour les électrons dans les molécules. Et enfin dans le deuxième chapitre, nous présentons et analysons les énergies d'interactions chromophore-tyrosine obtenues sur une large grille de positions relatives.