Etude des caractéristiques des peroxydases d’origine végétale par bio-informatique

Abstract

Résumé : Les peroxydases sont des enzymes qui catalysent la réaction d’oxydo-réduction par un mécanisme de radical libre permettant la transformation de plusieurs composés en produits oxydés ou polymérisés, qui peuvent peut-être isolés à partir de plusieurs sources végétales tel que le radis, le navet et l’ail. L’objectif de ce mémoire consiste en l’étude des caractéristiques des peroxydases d’origine végétale par bio-informatique en déterminant les séquences protéiques afin de comparer les homologies de séquence des différentes enzymes observées. L’alignement multiple des séquences des peroxydases, a été réalisé au moyen de programmes bio-informatiques, tel que le MEGA X pour aligner les séquences et ESPript 3.0 pour analyser et visualiser les résultats. Les résultats de cet alignement ont montré que la peroxydase a plusieurs homologues mais notre étude, nous nous sommes intéressés qu’à celles ayant un fort pourcentage de similitude. Nous avons retenu pour cela quatre résultats dont le pourcentage supra-cité varie entre 91% et 100%, et où les acides aminés ; His170, His42, et Arg38 sont conservés autour de site actif. Mots clés : Peroxydases végétales , Alignement multiple, MEGA X , ESPript 3.0.