Etude de l'intéraction de la phospholipase A2 et flavanones isolées de l’Inule Visqueuse par modélisation moléculaire.

Abstract

The knowledge of the enzymes is capital, because itis catalyze the majority of the chemical reactions of the living organisms. The deterioration of the enzymes by specific inhibiters makes it possible to block the biochemical ways, only a particular site of enzymatic protein comes into contact with its substrate: it is the active site, This one is still divisible in two particular areas. The site can fixing; it possible the enzyme “to cling” to the molecule, and to position the latter in an optimal way, while the catalytic site starts the reactional process. Our work consists a study of molecular interaction between phospholipase PLA2 and the flavanons, the various molecular numerical models are used to conclude this work (mechanical molecular, dynamic molecular and docking molecular) , the docking makes it possible to envisage how a small molecule (drug) can bind to a receptor (protein) of which the structure 3D is known. La connaissance des enzymes est capitale, car ce sont elles qui catalysent la plupart des réactions chimiques des organismes vivants. L’altération des enzymes par des inhibiteurs spécifiques permet de bloquer les voies biochimiques, Seul un site particulier de la protéine enzymatique entre en contact avec son substrat : c’est le site actif, celui-ci est encore divisible en deux régions particulières. Le site de fixation permet à l’enzyme de « s’accrocher » à la molécule, et de positionner cette dernière de façon optimale, tandis que le site catalytique déclenche le processus réactionnel. Notre travail consiste à une étude d’interaction moléculaire entre la phospholipase PLA2 et les flavanones, Les différents outils de lamodélisation moléculaire sont utilisés pour mener à bien ce travail (mécanique moléculaire, dynamique moléculaire et docking moléculaire) où le docking permet de prévoir comment une petite molécule (drogue) peut se lier à un récepteur (protéine) dont la structure 3Dest connue.