ubiquitination and sumoylation analysis of the p53 protein

Abstract

La protéine suppresseur de tumeur p53 joue un rôle essentiel dans la régulation du contrôle du cycle cellulaire, la réparation de l'ADN et la mort cellulaire programmée. Les taux et l'activité de p53 sont étroitement régulés par diverses modifications post-traductionnelles (PTM) et la perturbation de ces dernières peut conduire au développement de maladies neurodégénératives. Dans cette étude, les sites d'ubiquitination, de SUMOylation et d'acétylation de la protéine p53 humaine ont été prédits in silico, en utilisant respectivement GPS-Uber, GPSSUMO/ SUMOplot et ASEB. Deux résidus K386 et K164 sont prédits comme étant sumoylés, ubiquitinés et acétylés, ce qui suggère une interaction potentielle des PTM sur ces sites spécifiques. La SUMOylation de p53 au niveau du résidu K386, situé dans le domaine régulateur C-terminal, augmente sa rétention dans le noyau et son activité transcriptionnelle. La modification du résidu K164, situé dans le domaine de liaison à l'ADN, pourrait permettre la dégradation de P53 par ubiquitination ou l'ajustement fonctionnel par acétylation et/ou SUMOylation. En outre, la protéine K351, présente dans le domaine de tétramérisation, est prédite pour être SUMOylée/Ubiquitinée. La SUMOylation au niveau de K351, qui pourrait empêcher l'ubiquitination médiée par MDM2, stabilise la rétention nucléaire de p53, contrairement à l'ubiquitination de K351 qui entraîne sa dégradation. Les résidus K292, K320 et K372 peuvent être le siège de deux MPT, SUMOylation-acétylation.