Epidémiologie microbienne des infections associées au SRAS-CoV-2

Abstract

La maladie pandémique à coronavirus 2019 (COVID‐19), causée par le syndrome respiratoire aigu sévère Coronavirus 2 (SRAS‐CoV‐2), a touché des millions de personnes dans le monde, en particulier les personnes qui avaient des facteurs de risque. Les infections virales respiratoires, prédisposent les patients aux co- infections, ce qui entraîne une augmentation des complications dues au COVID-19 et de la mortalité. Cependant, les co-infections du SRAS-CoV-2 avec d'autres micro- organismes, jouent un rôle important dans la survenue et le développement de l'infection tels que des virus, des bactéries et des champignons. Les co-pathogènes comprenaient des bactéries, telles que Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumonia, Legionella pneumophila et Acinetobacter baumannii ; espèces de Candida et Aspergillus flavus, et des virus tels que le virus de la grippe, le coronavirus, le rhinovirus/entérovirus, le virus de la parainfluenza et le virus de l'immunodéficience humaine. La pandémie du COVID-19 a eu un impact majeur sur l'utilisation des antibiotiques et une augmentation de l'incidence de la résistance aux antimicrobiens. En effet, il y a eu un développement rapide des organismes multirésistants y compris Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii résistants aux carbapénèmes, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline et les champignons du genre Candida auris un agent causal de la candidémie. Ainsi, cette synthèse bibliographique vise à résumer les données actuelles sur Les co-infections microbiennes et la pandémie du COVID-19. Mots-clés : co-infection microbienne, COVID‐19, infection concomitante, résistance aux antimicrobiens, SRAS‐CoV‐2.