La prévention de la liaison du SARS-CoV-2 sur l’ACE2 humain : étude in silico

Abstract

Le nouveau coronavirus virus SARS-CoV-2 provoque une pneumonie sévère chez l'homme, provoquant de graves épidémies. Vue la non disponibilité du vaccin dans les pays pauvres, les études in silico ont pris une importance primondiale nous avons fait un screening de dérivés de la quinine pour proposer un médicament potentiel qui inhibe la pénétration du SARS CoV-2 dans la cellule. On a utilisé Logiciel UCSF chimera (ver1.14) contient un sous programme vina, pour préparer la structure 3D de la protéine ACE2 (6VW1) qui comporte un inhibiteur co-cristallisé et faire un docking moléculaire. On a chargées Les cinq meilleures molécules directement l’une après l’autre dans le logiciel Discovery Studio visualizer (DSV), qui permet de visualiser les différents diagrammes d’interaction entre le site actif de l’enzyme et les ligands en 2D. Enfin les caractiristiques pharmacocinétiques ont été étudiés grace au site Swiss ADME. A la lumière de ce travail, nous pouvons postuler que les composés Prenyl Quinine et N-[4-[2-[(7- Methyl-6,7-dihydrothieno [3,2-d]pyrimidin-4-yl)amino]ethyl]phenyl]benzamide et Piperidyl- quinine possèdent avec un bon profil ADME et un pouvoir inhibiteur potentiellement élevé envers la cible, et peuvent par consėquent être proposés comme inhibiteurs potentiels de la ACE2 pour le traitement de CoV-19. Mots clés : SARS COV-2 - ACE2 – spike S – etude in silico – l’amarrage moléculaire