Master en Microbiologie

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Contribution à l’étude de l’effet anti-biofilm des extraits bruts des algues rouges
(University of Tlemcen, 2024-09-30) Ouchfoun, Imene
Ce mémoire explore les propriétés anti-biofilm des extraits bruts d’algues rouges et leur efficacité contre divers biofilms bactériens pathogènes. La question de recherche réside dans le développement d’un nouveau potentiel thérapeutique pour inhiber la formation de biofilms par des bactéries telles que Staphylococcus aureus et Pseudomonas aeruginosa, qui constitue un problème majeur de santé publique en raison de leur résistance croissante aux antibiotiques. Pour répondre à cette question, nous avons préparé et analysé des extraits bruts d'algues rouges collectés dans la région de Beni Saf Ain Témouchent. Des tests in vitro ont été réalisés pour évaluer leur capacité à inhiber la formation et la croissance de biofilms. Les résultats ont confirmé la présence de composés bioactifs dans les extraits d'algues rouges qui réduisent considérablement la formation de biofilms de S. aureus et de P. aeruginosa. En résumé, les extraits bruts d'algues rouges offrent un potentiel prometteur en tant qu'agents naturels anti-biofilm, offrant ainsi une alternative aux traitements antibiotiques classiques. Il est essentiel de mener des recherches supplémentaires afin de déterminer les composés bioactifs spécifiques et d'évaluer leur action sur une variété de microorganismes.
Etude de la Consommation des antibiotique et antibiorésistances au services du Maternité du CHU de Tlemcen
(University of Tlemcen, 2024-09-30) Benabdallah, Hanaa; Benyahia, Oum El Kheir Nawel
La consommation des antibiotiques est un sujet de préoccupation majeur en raison de son impact sur la résistance antimicrobienne. L’utilisation excessive et anarchique des antibiotiques contribue significativement à la résistance aux antimicrobiens, une situation qui empire avec des coûts sanitaires élevés et des hospitalisations prolongées. Le but de notre travail est de déterminer les taux de consommation des antibiotiques au service de maternité du CHU de Tlemcen ainsi que de déterminer la résistance a certains antibiotiques. A l’issue de ce travail Nous rapportons que pour les 168 patients inclus dans cette étude, 107 patients (soit 63,69%) recevaient au moins un antibiotique dont le Flagyl qui été la molécule la plus prescrite l’antibiothérapie été dans 94% des cas administrée dans un but prophylactique par contre l’antibiotique le plus consommé dans le service de maternité est la Cefazoline avec une DDJ de 2573,33 et le moins consommé est la ciprofloxacine avec une DDJ de 217. Les résultats de l’antibiogramme ont montré que les souches isolées du service de maternité sont totalement résistante à l’amoxicilline et la ceftriaxone ces résultats sont confirmés par des CMI supérieurs à 256 microgramme/ml. Par contre aucune résistance à la vancomycine n’a été signalée. En fin, Il est essentiel d'inclure des données de consommation pour assurer une utilisation efficace des antibiotiques à l'hôpital, ainsi qu'une surveillance étroite de la résistance aux antibiotiques
Isolement, Identification des souches de Rhizobium et recherche des activités enzymatiques
(University of Tlemcen, 2024-09-30) Elmamoune, Meriem; Chebbab, Hanene
Notre travail avait pour objectif d’isoler et de purifier des bactéries Rhizobium à partir de plantes Vicia faba récoltées de trois sites différents de la wilaya de Tlemcen. Les résultats d’isolement et purification des bactéries sur les différents milieux de cultures (YMA , YMA +BTB et YMA+RC) ont permis d’obtenir 14 souches ayant les caractères morphologiques microscopiques et macroscopiques des Rhizobium dont la plupart des souches acidifient le milieu YMA+BTB. Afin de confirmer notre identification, nous avons utilisé les différents tests qui ont montré tous les caractéristiques biochimiques chez les autres Rhizobium. Neuf souches ont été orientées pour la recherche de leurs activités enzymatiques. Les résultats ont montré la présence d’une activité amylolytique et cellulosique et l’absence de l’activité lipolytique et gélatinase. Concernant l’activité protéolytique, les souches présentaient une faible hydrolyse de la caséine.
Etude de l’adhésion des staphylocoques sur dispositifs cardiaques implantables
(University of Tlemcen, 2024-09-18) Gheroussat, Sabah; Boutchiche, Amel
Résumé : L’utilisation des dispositifs cardiaques implantables comporte un risque d’infection, principalement lié à la formation des biofilms à la surface du dispositif. Les infections associées à ces dispositifs peuvent être graves, entrainant parfois des complications potentiellement mortelles telles que l’endocardite. Les staphylocoques sont fréquemment impliqués dans la formation de biofilm sur les DCI. Cinq souches de staphylocoque à coagulase négative sont isolées à partir des dispositifs cardiaques implantables pour testées leur capacité à former un biofilm, et étudiér l’influence de la nature du dispositif sur la formation de biofilm. La majorité des souches formatrices de biofilm sont des Staphylococcus epidermidis. Les souches semblent mieux adhérées à la sonde (silicone) qu’au boitier et connectine.
Isolement des bactéries actinomycètales productrices de substances antimicrobiennes à partir de la grotte de Ghorf El Mit (Beni Mathar – Tagma)
(University of Tlemcen, 2024-09-18) Amara, Manel; Bousmaha, Nabila
L'évolution constante de la résistance des microbes aux antibiotiques et l'apparition de nouvelles maladies infectieuses expliquent l'urgence de trouver des nouvelles molécules antimicrobiennes adéquates. L’usage irresponsable des antibiotiques accroît considérablement la résistance des microbes .En revanche, le taux de décès lié aux infections a augmenté. De cette manière, il est primordial de chercher de nouveaux composés présentant des structures chimiques. Les écosystèmes algériens renferment une diversité fascinante de microorganismes qui peuvent constituer une source précieuse de molécules antimicrobiennes d'une grande diversité. L'objectif de cette étude s'inscrit dans le contexte de la recherche des actinomycètes qui produisent des molécules bioactives à partir des échantillons de sol de la grotte de Ghorf El Mit, située à la région de Tagma dans la wilaya de Tlemcen. Des isolements sélectifs des actinomycètes ont été effectués, en utilisant la méthode de suspension dilution. Les milieux ISP2 et Bennett conviennent mieux à l'isolation des actinomycètes (9 souches ont été isolées à partir du milieu ISP2 et 4 souches d’actinomycètes ont été isolées à partir du milieu Bennett) Le screening de l’activité antimicrobienne est effectué par deux méthodes de diffusion sur gélose (méthode de cylindre d’agar et méthode des puits). L’évaluation de l'activité antimicrobienne a été réalisée vis-à-vis des bactéries pathogènes suivantes : Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Bacillus subtilis, Enterococcus feacalis, Klebseilla pneumonea, Staphylococcus aureus, ainsi qu'une levure Candida albicans. Les diamètres des zones d’inhibition varient entre 08 et 13 mm, où la souche la plus sensible est A9 (19) contre C.albicans avec une zone d'inhibition comprise entre 12 et 13 mm et contre E.coli avec des zones d'inhibition mesurant entre 11 et 13 mm. Trois souches actinomycètales sur 18 isolats sont présenté une activité antimicrobienne : les souches A6(18) -A9(19)- A31(2) Selon les tests d’identifications effectuées et l'observation microscopique .les souches appartiennent probablement au genre Streptomyces qui sont des bactéries filamenteuses Gram positif saprophytes et non pathogènes, sont principalement présentes dans les couches superficielles des sols, se développent et se dispersent grâce à leur croissance mycélienne et leur capacité de sporulation. Les actinomycètes sont une source prodigieuse de molécules antimicrobiennes d’une grande diversité. Les écosystèmes algériens abritent une variété intéressante de microorganismes qui peuvent avoir des activités biologiques.
The impact of hospital wastewater from Tlemcen University Hospital Center on multi-drug resistant bacteria
(University of Tlemcen, 2024-09-18) Bhusvumani, Steven
Multi-drug resistance is a major global threat, especially in healthcare settings. Hospitals generate wastewater that acts as a reservoir for multidrug-resistant bacteria. Hospital wastewater, if untreated or poorly treated, can disseminate resistant pathogens into the environment, posing significant risks to public health and ecological systems. This study aims to qualitatively assess the presence of bacteria and multidrug-resistant bacteria in the hospital wastewater of Tlemcen University Hospital. Hospital wastewater samples were collected from 3 different units of the hospital which are the Pneumo-phthisiology, Hematology, and Neurosurgery units. Bacterial isolation was performed using selective and differential agar media to selectively promote the growth of target ESKAPE bacteria. Antibiotic susceptibility testing was carried out using the Kirby-Bauer disc diffusion method according to Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines to determine resistance profiles. The research revealed the presence of bacteria in the hospital wastewater, including the occurrence of multidrug-resistant bacteria. Predominantly, MDR bacteria from the Enterobacteriaceae family were found in the Hematology unit, while MDR Pseudomonas spp. were prevalent in the Pneumo-phthisiology unit. The study also identified Staphylococcus spp., which demonstrated susceptibility to the tested antibiotics. However, Pseudomonas spp. exhibited high resistance to Ciprofloxacin and Tobramycin across multiple units. The findings highlight the crucial need for efficient hospital wastewater treatment to prevent the spread of antibiotic resistance. MDR bacteria in wastewater pose major threats to public health.
Etude de la résistance à certains agents antimicrobiens des staphylocoques isolés du service de maternité du CHU de Tlemcen
(University of Tlemcen, 2024-09-15) Chaouche, Sarra; Zerrougui, Sihem
Les staphylocoques commensaux normaux de la microflore cutanée et muqueuse sont responsables de nombreuses infections dans tous les services hospitaliers et plus particulièrement le service de maternité, ces infections peuvent être compliquée par le phénomène de résistance qui touche les antibiotiques et les biocides .L’objectif de notre travail vise à isolées les souches du genre Staphylocoques à partir des surfaces inertes au niveau du service de maternité du centre Hospitalo-universitaire de Tlemcen, tester l’activité antimicrobienne des antibiotiques et certains biocides utilisés par la méthode de diffusion sur gélose et déterminer les concentrations minimales inhibitrices nécessaire pour éliminer ces microorganismes par la méthode sur microplaque. Les résultats obtenus montrent que les staphylocoques isolées des surfaces au service de maternité sont résistants a la majorité des antibiotiques testés sauf à la Vancomycine qui garde toujours une bonne activité par contre la Bétadine et la Bactinyl 5M PE, démontrent un pouvoir antimicrobien très efficace. Pour conclure la sur utilisation des antibiotiques et des biocides peut contribuer au développement de la résistance bactérienne ce qui rend essentiel la mise en œuvre de mesures efficaces pour contrôler le développement des infections dans les milieux hospitalier et l’instauration des systèmes de surveillance de la résistance aux antimicrobiens.
Séroprévalence du VIH au niveau du Centre De Référence (CDR) de TLEMCEN
(University of Tlemcen, 2024-09-15) Djelti, Abdelmadjid; Morsli, Sihem
L'infection par le VIH reste une préoccupation majeure en matière de santé publique. Une étude séroépidémiologique a été conduite au centre de référence de Tlemcen, s'étendant du 1er janvier 2023 au 31 décembre 2023. Son objectif est d'analyser les caractéristiques épidémiologiques, cliniques et biologiques de cette maladie. Un total de 68 patients, répondant aux critères d'inclusion, ont été pris en compte dans cette étude. Les résultats révèlent une prévalence élevée avec 25 personnes chez les jeunes adultes de 21 à 40 ans, 63% représente une prédominance masculine et un sexe ratio de 1.7. Le statut marital montre une prévalence plus élevée chez les célibataires avec une fréquence de 38%. La provenance des patients montre une concentration des cas dans la wilaya de Tlemcen avec 31 malades. Le mode de vie indique une prédominance des indéterminés à 41% suivi par les UDI de 32%, la circonstance de découverte représente une supériorité dans la fréquence de dépistage de 44.11%, bilan de routine à 41.17% et 73% représente Le stade B de la maladie. Les caractéristiques biologiques avec 58 cas de FNS normal, 64% sérologie positive et 40 cas avec une CV fortement élevée, Enfin les caractéristiques évolutives mettent en évidence des résultats variables, avec des améliorations de santé chez la majorité des patients avec 59 évolution favorable mais aussi des évolutions défavorables et des décès, soulignant l'importance d'un suivi médical régulier.
Élaboration d’un yaourt à base de caroube et sésame
(University of Tlemcen, 2024-07-14) Belfilali, Bilal; Belarbi, Amrane
Les innovations récentes dans les produits de yaourt ont suscité un intérêt accru chez les consommateurs, ce qui nous a conduit à développer un yaourt aux bienfaits pour la santé, particulièrement pour les maladies chroniques, en y intégrant la farine de la caroube et du sésame. Les résultats des analyses sensorielles ont révélé une préférence des dégustateurs pour les yaourts aux caroubes et au sésame, qui ont obtenu des évaluations supérieures par rapport aux autres. Tous les yaourts testés présentaient des valeurs de pH acceptables, variant de 4,3 à 4,4, et une acidité titrable entre 73°D et 86°D. Le yaourt au sésame avait la plus haute teneur en matière grasse avec 10 %, tandis que le yaourt aux caroubes avait la plus haute teneur en matière sèche, atteignant 10,06 %. En termes de qualité microbiologique, tous les yaourts étaient exempts de contaminants et de germes pathogènes, avec des concentrations de Streptococcus thermophilus de 276×10³ UFC/ml et de Lactobacillus bulgaricus de 84×10³ UFC/ml dans chaque type de yaourt. Cette étude contribue à définir les caractéristiques des yaourts étudiées, aidant ainsi l'industrie à développer des produits de haute qualité avec des bénéfices sanitaires scientifiquement prouvés. Elle souligne également l'importance d'explorer différentes concentrations de caroube et de sésame, ainsi que l'ajout de substituts naturels de sucre dans les yaourts
Etude de la biodégradabilité du plastique par les champignons tellurique des grottes d’Ain fezza
(University of Tlemcen, 2024-07-03) Hadjoudj, Khadidja
La pollution par le plastique constitue un problème majeur de santé publique et de l’environnement ; dont lequel les champignons confèrent une biodégradation des plastiques ce qui aide à diminuer ce problème. Le présent travail consiste a été inventorier les champignons telluriques pouvant dégrader le plastique. L’échantillonnage est réalisé sur des sols de la grotte de « Ghar Sokhrane»de la région de « Ain Fezza» de la wilaya de Tlemcen. Pour réaliser le test de biodégradation on a ensemencé cinq flacons contenant le milieu Czapex par 1 ml de la suspension de solution mère de chaque échantillon du sol pendant 70 jours ; La mise en évidence de la dégradation des morceaux de plastique se fait par l’observation de la croissance des champignons autour des morceaux de plastique. Ensuite, pour réaliser l’isolement de ces champignons , on a ensemencé les morceaux de plastique attaqués par les particules du sol dans des boites de pétri contenant le milieu PDA additionné du Rose Bengal pendant7 jours ; l’identification macroscopique et microscopique par la technique de microculture et la méthode de scotch nous a permis de rapprocher la souche E2-2 à l’espèce Beauveria felina et la souche E3-2 au genre Aspergillus .
Évaluation de l’activité antimicrobienne des extraits de feuilles du safran «Crocus sativus » contre les souches cliniques «Entérobactéries »
(University of Tlemcen, 2024-07-03) Tikhmarine, Ikhlasse; Djedid, Fatiha
Un traitement à long terme aux antibiotiques conduit à l'acquisition de résistances par les bactéries, ce qui présente un risque majeur pour la santé humaine. Par conséquent, l’utilisation des plantes médicinales est devenue bien meilleure. Parmi eux se trouve le safran (Crocus sativus), qui est une plante très riche en composants ayant un effet bénéfique sur la santé humaine. Cette étude se concentre sur l’évaluation de l’activité antimicrobienne de différents extraits et des fractions des feuilles du C. sativus (extrait aqueux, extrait acétate d’éthyle, fraction aqueuse et fraction méthanolique) contre les entérobactéries (Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli ,Enterobacter cloacae et une souche de référence : Escherichia coli TEM-1 ) par la méthode de diffusion sur gélose , la méthode de détermination des concentrations minimales inhibitrices et bactéricides (CMI et CMB) et la Bioautographie. Selon les résultats obtenus, les extraits d’acétate d’éthyle et aqueux donnent une faible activité antimicrobienne contre E. coli (E4) avec un diamètre de 7mm et 8 mm, respectivement. De plus la fraction aqueuse inhibe la croissance de toutes les souches testées avec une concentration inhibitrice de 0,3625mg/mL et un rapport frontale (Rf=0,34 et 0,45) à 365nm contre E. coli (E4). Les feuilles de Crocus sativus peuvent être utilisées comme une source de substance naturelle à activités antimicrobiennes
Enquête sur les infections urinaires associées à la Covid-19
(University of Tlemcen, 2024-06-27) Gourari, Hanaa Amina; Riffi, Nihal Aya
Connu pour ses effets graves sur le système respiratoire, le Covid-19 affecte également d'autres organes, en particulier les voies urinaires. Notre étude est une enquête visant à explorer l'association entre la Covid-19 et les infections urinaires, à l'aide d'un questionnaire mis en ligne. 121 individus de différentes régions du pays y ont répondu, dont 82 ont affirmé avoir déjà été infectés par la corona virus. 31 d’entre eux, ont contracté une infection urinaire pendant ou après la Covid-19. Les résultats ont montré que les infections urinaires étaient fréquentes chez les sujets Covid-19, en particulier les hommes et les personnes âgées. Il semblerait que les hypertendus et les personnes atteintes des maladies rénales, soient plus sensibles aux infections urinaires lorsqu’elles sont infectées par la Covid-19. L’hospitalisation ainsi que la respiration artificielle favoriseraient également les infections urinaires chez les sujets covid-19 comme le montre nos résultats.
Evaluation de l’activité antimicrobienne des extraits et des huiles essentielles de Prunus avium
(University of Tlemcen, 2024-06-25) Dekkar, Wissem; Cherif, Ghizlene Zoubida
L'étude des propriétés thérapeutiques du Prunus avium, un arbre fruitier de la famille des rosacées, présente un grand intérêt. Les extraits ont été préparés par macération dans de l'éthanol et/ou de l'eau distillée et les huiles essentielles ont été extraites par hydrodistillation. L'activité antibactérienne a été évaluée par une méthode de diffusion sur six souches bactériennes et une souche de levure. Les rendements d’extraction variaient en fonction de la partie végétale et du solvant utilisé. Les extraits aqueux des feuilles et éthanoliques et aqueux de fleurs ont montré une activité antibactérienne la plus élevée, révélant une sensibilité accrue à Staphylococcus aureus.
Isolement des moisissures productrices de substances antimicrobiennes à partir de la Grotte de Noufigher– Ghardaia
(University of Tlemcen, 2024-06-23) Cheradi, Rokia
Compte tenu de la fréquence des micro-organismes pathogènes multirésistants émergents, la découverte de nouveaux antibiotiques et d’autres métabolites microbiens bioactifs est une priorité absolue. En conséquence, les scientifiques recherchent de nouveaux antibiotiques isolés de microbes des habitats extrêmes tels que les grottes. Les écosystèmes Algériens abritent une variété fascinante de micro-organismes qui constituent des sources importantes d’un large éventail de molécules antimicrobiennes. Dans notre recherche, nous avons été fascinés par la recherche de champignons producteurs de molécules bioactives de la Grotte de Noufigher située dans la wilaya de Ghardaïa. Tandis que les sédiments et les roches étaient échantillonnés, 11 souches fongiques ont été sélectivement isolées. Les isolats identifiés appartenaient aux genres Aspergillus (2/11), Penicillium (4/11), Cladosporium (1/11) et Trichoderma (4/11).
Etude de quelques paramètres biochimiques chez les patients atteints du syndrome coronarien
(University of Tlemcen, 2014-09-04) Bouayed, Imène
Résumé: La pathologie cardiovasculaire, en particulier le syndrome coronarien, constitue un problème majeur de santé publique dans tous les pays, par sa fréquence, sa létalité et ses répercussions socio économiques. L’objectif de notre travail est d’évaluer quelques paramètres biochimiques (urée, créatinine, acide urique, protéines totales, cholestérol total, triglycérides), et voir leur influence sur l’apparition et le développement du syndrome coronarien. Pour cela une étude a été réalisée dans la région de Tlemcen, chez deux populations, une population témoin en bonne santé (n=15), et une population atteint du syndrome coronarien (n=15) recrutée au service de cardiologie du C.H.U de Tlemcen. Nos résultats montrent qu’il existe effectivement des altérations des paramètres biochimiques : dont on a trouvé une augmentation significative d’urée, de créatinine, d’acide urique, de cholestérol total, et des triglycérides, chez les sujets coronariens comparés aux témoins. En conclusion, nos résultats permettent de conclure que le syndrome coronarien est associé à des perturbations des paramètres biochimiques. Ainsi, un dépistage est important pour prévenir tout risque cardiovasculaire conséquence de l’athérosclérose. Mots clés: pathologie cardiovasculaire, syndrome coronarien, athérosclérose, paramètres biochimiques. Abstract: Cardiovascular pathology, in particular coronary syndrome, is a major problem of public health in all countries, by its frequency, its lethality, and its socio-economic impact. The objective of our study is to assess some biochemical parameters (urea, creatinine, uric acid, total protein, total cholesterol, triglycerides), and evaluate their influence on the emergence and development of coronary syndrome. For this, a study was conducted in the region of Tlemcen, in two populations, a healthy control population (n=15), and a population with a coronary syndrome (n=15) recruited in cardiology service of C.H.U Tlemcen. Our results showed an alterations in biochemical parameters. In fact, urea, creatinine, uric acid, total cholesterol, and triglycerides were increased in coronary patients compared to controls. In conclusion, our results suggest that coronary syndrome is associated with changes in biochemical parameters. Thus, screening is important to prevent cardiovascular risk consequence of atherosclerosis.

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