Élaboration d’amorces pour l’amplification de l’exon 2 du gène de la sélénoprotéine : glutathion peroxydase 1

Abstract

La glutathion peroxydase est la protéine antioxydante la plus importante de la famille des sélénoprotéines. Elle permet de réduire et de détoxifier différents types de peroxydes en leur alcool correspondant, et ce aux dépens du glutathion. Elle constitue ainsi l’armure essentielle de l’organisme contre le stress oxydatif. La famille des glutathion peroxydases compte plusieurs membres, dont la glutathion peroxydase 1(GPX1) qui est intracellulaire. Le gène GPX1 est localisé au niveau de la région 3p21.31 du chromosome 3. L’objectif de ce travail est de concevoir avec spécifié un couple d’amorce encadrant un SNP C/T, au niveau du rs1050450 de l’exon 2 de l’enzyme glutathion peroxydase 1, de façon à amplifier cet exon. L’utilisation du Primer-BLAST nous a permis de concevoir plusieurs couples d’amorces d’une longueur d’environ 20 nucléotides. La spécificité de ces amorces a été vérifiée grâce à l’outil UCSC. Le couple d’amorce le plus spécifique, encadrant la région d’intérêt, a été retenu. En biologie moléculaire, la bioinformatique représente une étape cruciale avant toute manipulation. La conception d’amorces permettra d’étudier l’implication d’un polymorphisme génétique dans la survenue d’une pathologie associée au niveau de notre population.