Etude des mécanismes de résistance aux antibiotiques chez Escherichia coli au niveau des hôpitaux de l’Ouest algérien

Abstract

Résumé: Escherichia coli est un pathogène opportuniste, à fort potentiel épidémique, fréquemment impliqué dans les infections nosocomiales. L’augmentation et la dissémination de la résistance aux antibiotiques chez cette espèce, représente un problème majeur de santé publique à l’échelle mondiale. L’objectif de cette étude multicentrique est de faire le point sur l’état actuel de la résistance aux antibiotiques chez E. coli dans les hôpitaux du Nord-Ouest algérien. Un total de 240 souches d’E. coli a été collecté, entre Octobre 2008 et Juin 2012, à partir de différents services des centres hospitalo-universitaires de Tlemcen, Sidi Bel Abbes et Oran. L’étude de la sensibilité aux 22 antibiotiques, dont 13 β-lactamines, 4 aminosides, 3 quinolones, le triméthoprime/sulfaméthoxazole et la colistine, a révélé des taux de résistance élevés pour la plupart des antibiotiques testés. Différents gènes de résistance aux β-lactamines ont été détectés avec dominance du gène codant la β-lactamase à spectre élargi (BLSE) CTX-M-15 et émergence de nouveaux gènes blaTEM-167 et blaCMY-16. D’autres gènes de résistance aux aminosides (armA, rmtB, aac(6’)-Ib, aadA et aadB), aux quinolones (aac(6’)-Ib-cr) au triméthoprime/sulfaméthoxazole (dfrA) et à la colistine (mcr-1) ont été également détectés. La dissémination des gènes de résistance, au niveau des CHUs étudiés, est liée principalement à la circulation du clone épidémique ST405, clone à haut risque international et au transfert de plasmides de différents groupes d’incompatibilité (IncF, IncFIA, IncL/M, IncI1, IncA/C et IncN) entre souches non reliées génétiquement. Dans cette étude on rapporte pour la première fois en Algérie, la détection des gènes de résistance aux aminosides (armA et rmtB) et à la colistine (mcr-1) chez des souches cliniques d’E. coli, soulignant ainsi l’augmentation de la fréquence des souches multirésistantes, dans cette espèce, dans les hôpitaux algériens, ce qui nécessite d’établir des mesures de contrôle pour éviter leur diffusion. Abstract: Escherichia coli is an opportunistic pathogen with a high epidemic potential, frequently involved in nosocomial infections. The increase and dissemination of antibiotic resistance in this species is a major public health concern worldwide. The aim of this multicentric study is to make the point on the current situation of antibiotic resistance in E. coli in hospitals of North-Western Algeria. A total of 240 strains of E. Coli was collected, between October 2008 and June 2012, from various wards of the university hospitals of Tlemcen, Sidi Bel Abbes and Oran. The study of susceptibility to 22 antibiotics, including 13 β-lactams, 4 aminoglycosides, 3 quinolones, trimethoprim/sulfamethoxazole and colistin, revealed high levels of resistance for most of the antibiotics tested. Different β-lactam resistance genes were detected with dominance of gene encoding the extended spectrum β-lactamase (ESBL) CTX-M-15 and the emergence of new genes blaTEM-167 and blaCMY-16. Other genes of resistance to aminoglycosides (armA, rmtB, aac(6’)-Ib, aadA and aadB), quinolones (aac(6’)-Ib-cr), trimethoprim/sulfamethoxazole (dfrA) and colistin (mcr-1) were also detected. The dissemination of resistance genes, in the hospitals included in this study, is mainly linked to the circulation of the high-risk international clone ST405 and the transfer of plasmids belonging to different incompatibility groups (IncF, IncFIA, IncL/M, IncI1, IncA/C and IncN) between strains unrelated genetically. In this study we report for the first time in Algeria, the detection of aminoglycosides resistance genes (armA and rmtB) and colistin resistance gene (mcr-1) in clinical strains of E. coli, pointed out the increase of the frequency of multiresistant strains, in this species, in algerian hospitals, which requires the establishment of control measures to avoid their spread.