Modélisation Moléculaire : Classification Et Intérêt Dans La Conception Des Médicaments

Abstract

Le monde de la chimie, aussi vaste et compliqué, nécessite des efforts immenses pour essayer de comprendre ses phénomènes. Parmi ces derniers, la modélisation moléculaire est élaborée depuis l’arrivé de l’ère de l’informatique. Cette discipline, étant en plein émergence, trouve sa place dans de nombreux domaines, plus particulièrement, le domaine pharmaceutique. Actuellement, elle est devenue assistée par ordinateur, c’est le « Computer Aided Drug Design » (CADD) donnant naissance à deux grandes catégories de stratégies, en fonction de la disponibilité de structure 3D de la protéine cible, celle basée sur la cible (SBDD) et l’autre basée sur le ligand (LBDD). La SBDD nécessite l’existence préalable de la structure 3D de la cible élaborée avec modélisation par homologie ou bien prédiction « de novo ».Cette classe est caractérisée par le Docking précédé par la dynamique moléculaire (DM) du complexe protéine-ligand. La LBDD, basant sur l’interaction entre le ligand et la cible et ne requière pas la structure 3D de la cible, les méthodes utilisées majoritairement le QSAR et les modèles pharmacophores. Récemment, suite à une modernisation très intéressante en termes de puissance de logiciel de calcul et de stockage, l’intelligence artificielle (IA) s’intègre dans ce processus. Ce domaine connait une évolution remarquable et se révolutionne encore et encore dans les années à venir.