Analyse in silico des nsSNP à conséquence fonctionnelles sur le TGF-β dans le cancer colorectal

Abstract

Le cancer colorectal (CCR) est un des cancers les plus répandus dans le monde. La signalisation du facteur de croissance transformant-bêta (TGF-β) est l’une des voies cellulaires importante dans le contexte de l’inflammation et de la tumorigenèse en modulant la croissance, la différenciation, l’apoptose et l’homéostasie des cellules. L’objectif de cette étude était de prédire les nsSNP délétères dans les gènes TGFBR2 et SMAD7 par le biais d’une analyse in silico. L’analyse in silico des nsSNP a été réalisée à l’aide des outils bio-informatiques accessibles en ligne. Nous avons analysé 287 nsSNP dans le gène TGFBR2 et 282 nsSNP dans le gène SMAD7 pour déterminer leurs effets sur ces protéines. Ce travail nous a permis de sélectionner 13 nsSNP à haut risque pour le gène TGFBR2 et 12 à haut risque pour le gène SMAD7. Mots clés: CCR, TGF-β, TGFBR2, SMAD7 nsSNP, analyse in silico.