Etude phylogénétique du SARS-COV 2 et comparaison des séquences et identification des positions des mutations.

Abstract

Le SARS-COV 2, nommé covid-19, un virus qui fait partie d’un grand groupe de virus connu depuis les années 1960s appelées les coronavirus, a déclenché une pandémie globale en Décembre 2019 qui a eu un impact majeur sur la santé public notamment l’économie des pays les plus touchées, l’infection par ce dernier développe chez les patients une toux, la fièvre et une dyspnée, cette phase d’invasion viral est suivi d’une réaction immunitaire inadaptée marquée par l’aggravation du symptomatologie respiratoire. Il est connu que les chauves-souris sont le réservoir naturel des coronavirus mais jusqu'à présent l’origine de SARSS-COV 2 et sa capacité de se transmettre à l’humain reste jusqu’à présent ambigüe, de ce fait nous avons réalisé une étude phylogénétique entre 11 pays afin de suivre la diversité et l’évolution de ce virus et par la suite une comparaison des séquences des deux clades G et O du Covid-19 a était établit pour déterminer les positions de mutations que ce virus a subis au cours de son évolution, En visant à la fin d'envisager l’impact des mutations sur le comportement du virus et son effet sur les cellules hôtes. Mots clés : SARS-COV 2, arbre phylogénétique, mutations