Inhibiteurs de la fixation des protéines BabA et SabA aux antigènes Lewis. Cas du lymphome gastrique

Abstract

L’Helicobacter pylori par ses mécanismes d’adhésion et de colonisation, est à la source de plusieurs pathologies gastriques incluant les lymphomes gastriques. Les principales protéines intervenant dans ces mécanismes sont BabA et SabA. L’étude a pour but de trouver des molécules susceptibles d’inhiber l’action de BabA et SabA. Il a donc consisté dans un premier temps en l’étude de l’amarrage moléculaire de 40 sous structures du Fucoïdane, par un screening réalisé en amont suivi ensuite par un Docking moléculaire. Au total 07 molécules ont été trouvées présentant de très bonnes affinités avec les deux protéines. Ces molécules présentent également des propriétés pharmacocinétiques adéquates pour être administrer. L’étude présente aussi une phase de simulation de dynamique moléculaire effectuée avec une molécule qui, selon les résultats ressortis sur les rmsd, rmsf et Gyrate, montre une grande stabilité en système, tant avec BabA qu’avec SabA. Mots clés : Helicobacter pylori, BabA, SabA, Fucoïdane, Docking moléculaire, dynamique moléculaire