Analyse in silico des SNPs à conséquences fonctionnelles Sur le CD172a, SHP1 et SHP2

Abstract

Les protéines SIRPα, SHP1 et SHP2 forment des complexes qui interagissent pour réguler divers processus cellulaires, notamment la phagocytose et la signalisation immunitaire. Le polymorphisme de ces protéines pourrait être impliqué dans de nombreuses maladies tels que les cancers. Cette étude a exploré les conséquences fonctionnelles des polymorphismes d'un seul nucléotide non-synonymes (nsSNP) sur SIRPα, SHP1 et SHP2, à l'aide de différentes méthodes in silico afin de prédire les variations dommageables. L’analyse in silico a été réalisée par quatre outils différents (SIFT, PolyPhen-2, PROVEAN, PANTHER) pour obtenir les SNP délétères. Ensuite, les nsSNP ont été soumis à une analyse fonctionnelle à l'aide des outils InterPro et Pmut. L'outil I-Mutant 2.0 a ensuite été utilisé pour prédire les changements dans la stabilité des protéines lorsqu'une mutation se produit, tandis que ConSurf a été utilisé pour analyser la conservation évolutive de ces protéines.