2025Analyse in silico des SNPs à conséquences structurelles et fonctionnelles sur SHP1 et SHP2 : Prédiction des modifications post traductionnelles et modélisation moléculair

Abstract

Introduction : SHP1 et SHP2 sont deux protéines tyrosine phosphatases non réceptrices intervenant dans la régulation de nombreuses voies de signalisation cellulaire. Tandis que SHP2 est exprimée de manière ubiquitaire dans les cellules des mammifères et agit principalement comme un régulateur positif des voies de signalisation, SHP1 est, quant à elle, principalement exprimée dans les cellules hématopoïétiques et est généralement considérée comme un régulateur négatif de diverses cascades de signalisation. Leur dérégulation est associée à plusieurs pathologies, notamment les maladies auto-immunes, les cancers et les troubles inflammatoires. Dans cette étude, nous avons réalisé des analyses in silico des polymorphismes nucléotidiques simple ayant des conséquences structurelles et fonctionnelles sur SHP1 et SHP2 Matériels et méthodes : Nous avons utilisé plusieurs outils bio-informatiques pour la prédiction des modifications post-traductionnelles, notamment GPS6.0, MusiteDeep, NETPhos 3-1, GPS-MSP, GPS-UBER, PRmePRed, Deep nitro, Icarps, GPS-YNO2 et GPS-SNO 1.0. Par la suite, une modélisation moléculaire des protéines variées a été réalisée à l’aide de SWISS MODEL, suivie d’une évaluation de la qualité structurale par ERRAT et PROCHECK, l’o