Sémantification du Dossier de Patient.

Abstract

Le Dossier Electronique du Patient (DEP) permettra de regrouper toutes les données médicales pertinentes pour le traitement d’un patient. Le présent travail de master rentre dans le cadre du Web sémantique et son application au domaine médical. Il consiste à faire une sémantification du dossier électronique du patient (XML) à base d’ontologies (OWL). Quatre ontologies (OWL) ont été choisies : (1) une ontologie médicale schématisant les concepts clés de la pratique médicale; (2) une ontologie familiale illustrant les relations familiales ; (3) une ontologie documentaire représentant l’organisation logique d’un dossier électronique du patient ; (4) une ontologie de vie privée montrant les niveaux de confidentialité et les droits d’accès. Les deux premières ontologies ont été adoptées à partir de l’existant pendant que les deux dernières ont été créées par nous-mêmes. La sémantification consiste à créer des annotations sémantiques (RDF) de parties du dossier électronique du patient par des concepts émanant de l’une des quatre ontologies précitées. La sémantification peut se faire selon deux approches : semi-automatique et automatique. Dans la première, les annotations sont créées par un expert humain à travers un outil logiciel (annotateur sémantique). Dans la seconde, les annotations sont générées automatiquement à partir du dossier électronique du patient à travers une feuille de style XSLT (générateur d’annotations sémantiques). Les annotations sémantiques résultantes sont ensuite interrogées grâce à SPARQL.