Caractérisation des variants hyperactifs de SIRPα modulant la résistance à la phagocytose.

Abstract

La protéine SIRPα (Signal Regulatory Protein Alpha) joue un rôle essentiel dans la régulation de la réponse immunitaire innée grâce à son interaction avec CD47. Les polymorphismes nucléotidiques simples non synonymes (nsSNP) peuvent influencer les propriétés structurales et fonctionnelles de cette protéine. Cette étude a été réalisée dans le but d’évaluer l’impact potentiel des nsSNP de SIRPα à l’aide de différentes approches bioinformatiques. Un total de 150 nsSNP a été collecté puis analysé par les outils SIFT, PolyPhen-2 et PROVEAN. Les variants prédits comme tolérés ou non délétères ont été retenus pour des analyses complémentaires. Leur effet sur la stabilité protéique a été évalué à l’aide d’I-Mutant 2.0 et DUET, tandis que Missense3D a été utilisé pour étudier les modifications structurales potentielles. Les conséquences moléculaires des mutations ont également été examinées à l’aide de MutPred2 et l’impact éventuel sur le peptide signal a été analysé par SignalP. À l’issue des différentes étapes de filtrage, cinq variants ont été sélectionnés pour des analyses approfondies. Ces derniers ont fait l’objet d’une modélisation tridimensionnelle suivie d’études de docking moléculaire afin d’évaluer leur influence sur la structure de SIRPα et sur ses interactions protéiques. Les résultats obtenus suggèrent que certains variants, bien que prédits comme tolérés par les outils de prédiction fonctionnelle, peuvent induire des modifications de stabilité, de structure ou d’interactions moléculaires. Ces observations soulignent l’intérêt de combiner plusieurs approches bioinformatiques pour mieux comprendre les effets potentiels des variations génétiques de SIRPα.