Conception des amorces du gène IRF4 impliqué dans la régulation de la différenciation des cellules Th9

Abstract

Les lymphocytes Th9 producteurs principalement d'IL-9 ont été découverts il y a plus d'une décennie et sont connus par leurs réponses anti-tumorale et leur protection contre les helminthes. À l'inverse, les cellules Th9 sont également impliquées dans la physiopathologie des maladies inflammatoires et auto-immunes. Les cellules T naïves nécessitent la combinaison de TGF-β et d'IL-4 pour devenir des cellules Th9, et son réseau transcriptionnel résulte d’un équilibre entre les voies de signalisation induites par les différentes cytokines nécessaires à sa polarisation qui implique la fonction coordonnée des facteurs de transcription clés y compris l’IRF4 le plus important pour la production de l’IL-9. La continuité des études sur ce facteur et sur son gène exige une amplification par PCR, et ce travail présenté ici a permis la conception d’amorces spécifiques du gène IRF4 via l’utilisation de l’outil de bio-informatique « NCBI ». Au cours de cette étude nous avons pu obtenir la séquence complète génomique du gène IRF4 grâce à la base de données Ensembl. Un couple d’amorces spécifique a été obtenu encadrant l’exon 2 du gène IRF4 à l’aide du logiciel Primer-BLAST. Ces amorces donneront, après amplification par PCR, un produit de 821 paires de bases exploitable pour des différentes analyses.

Mots clé : cellules Th9, IRF4, PCR, conception d’amorces