Eco-éthologie et diversité génétique du Loup doré d’Afrique (Canis anthus) en Algérie

Abstract

Résumé Cette thèse vise comme objectif d’apporter de nouvelles connaissances sur l’écologie trophique, le comportement et l’organisation sociale ainsi que la diversité génétique d’une espèce récemment décrite, le Loup doré d’Afrique (Canis anthus). L’étude du régime alimentaire s’est effectuée dans la réserve de chasse de Tlemcen à partir de l’analyse de 246 crottes collectées durant un cycle annuel. Elle a montré le caractère généraliste et opportuniste chez ce canidé avec une tendance claire de prédation envers les proies de grande taille qui couvrent une biomasse de 65,32%. Le Sanglier (Sus scrofa) est la proie la plus consommée avec une fréquence d’occurrence de 28,05% et une biomasse de 41,51%. Les animaux domestiques, notamment les ovins, occupent une part occasionnelle mais relativement importante du spectre alimentaire, raison pour laquelle l’espèce est exposée à la persécution systématique par les chasseurs et les riverains. D’autres types d’aliments comme les fruits et végétaux, reptiles, insectes, oiseaux et déchets organiques sont consommés en faible quantité pour compléter son régime. Le Loup doré d’Afrique vie en groupes territoriaux dont trois ont été déterminés à l’intérieur de la réserve et quatre à l’extérieur. La taille de ses groupes varie de cinq à huit individus adultes avec une densité estimée à 1,98 groupes/10km2. Il partage son territoire avec d’autres espèces sympatriques en particulier la hyène rayée (Hyeana hyeana) comme ça été indiqué par les nombreux cas d’overmarking observés le long de l’année. L’analyse génétique de 51 échantillons de tissus, poils et crottes a confirmé l’existence du Loup doré d’Afrique en Algérie et l’absence du Chacal doré (Canis aureus). Elle a montré également une diversité génétique très élevée que ce soit pour le fragment d’ADNmt de la région de commande, qui a fait ressortir 17 haplotypes ou pour le génotypage de microsatellites (Ho=0,7 ; He=0,81), qui a révélé l’existence de cinq populations dans la partie Nord Algérienne avec des échanges de flux génétiques. L’approche de l’horloge moléculaire appliquée pour un fragment d’ADNmt de 342 bp de trois canidés, a montré que le dernier ancêtre commun entre C. anthus et C. lupus date depuis 1917 ans, par contre celui entre C. anthus et C. aureus date de plus de 3100 ans. Mots clés : Canis anthus, Canis aureus, écologie trophique, éthologie, diversité génétique, ADNmt, microsatellites, Tlemcen, Algérie. ملخص إیكو-إیثولوجیا وا لتنوع ا لوراثيللذئب ا لذھبي الأفریقي (كانیس أنثوس) في ا لجزائر تھدف ھذه الأطروحة إ لى توفیر معارف جدیدة عن ا لنظام ا لغذائي ، ا لتنظیم الاجتماعي و ا لتنوع ا لوراثي لنوع من ا لثدیاث وصف مؤخرا، ا لذئب ا لذھبي الأفریقي (كانیس أنثوس) أجریت دراسة ا لنظام ا لغذائيللذئب ا لذھبي الإفریقي على مستوى محمیة ا لصید بتلمسان من خلال تحلیل 246 من ا لفضلات ا لتي جمعت خلال دورة سنویة. أظھرت ا لنتائج ا لطابع ا لعام والانتھازي لھذا ا لنوع مع میول واضح نحو ا لفرائس ا لكبیرة ا لتي تغطي كتلة حیویة مقدرة ٪ ب 65.32 ٪. ا لخنزیر ا لبري (سیس سكروفا) ھو ا لفریسة الأكثر استھلاكا بوتیرة 28.05 وكتلة حیویة مقدرة ب 41.51 ٪. ا لحیوانات الألیفة، وخاصة الأغنام، مثلت حصة معتبرة من ا لطیف ا لغذائي، وھذا ما رجحناه كسبب لتعرض ھذا ا لنوع للاضطھاد من قبل ا لصیادین وا لسكان ا لمحلیین. ا لفواكھ ،ا لخضروات ،ا لزواحف ،ا لحشرات ،ا لطیور وا لنفایات ا لعضویة تم إستھلاكھا بكمیات صغیرة لتكملة نظامھ ا لغذائي أثبتت ھذه ا لدراسة أن ا لذئب ا لذھبي الإفریقي یعیش في مجموعات إقلیمیة حیث تم تحدید ثلاثة منھا داخل ا لمحمیة وأربعة خارجھا. تراوح عدد أفراد ا لمجموعة بین 5 و 8 ذئاب با لغین أین قدرة كثافة ا لمجموعات ب 1.98 مجموعة / 10 كم 2. ا لذئاب تشترك أراضیھا مع أنواع أخرى من آكلات ا للحوم و على وجھ ا لخصو ص ا لضبع ا لمخطط (ھییناھیینا) كما بین في ا لعدید من ا لحالات ا لتي لوحظت طوال فترة ا لدراسة. أكد ا لتحلیل ا لوراثي ل 51 عینة من الأنسجة ،ا لشعر وا لفضلات وجود ا لذئب ا لذھبي الأفریقي في ا لجزائر وغیاب إبن آوى ا لذھبي (كانیس أوریوس). أظھرت ا لنتائج تنوع وراثي مرتفع جدا سواءا على مستوى جزء منطقة ا لتحكمللحمضا لنووي ا لذي كشف عن ،( 17 ھابلوتیبس أو على مستوى ا لتنمیط ا لجیني میكروساتلیت (ھو = 0.7 ، و = 0.81 وا لتي فصلت خمس مجموعات في ا لجزء ا لشما لي من ا لجزائر مع وجود تبادلللتدفقات ا لجینیة فیما بینھا. أظھر نھج ا لساعة ا لجزیئیة ا لمطبقة على جزء من ا لحمضا لنووي ( 342 بب) ا لخا ص بثلاث أنواع أن ا لسلف ا لمشترك الأخیر بین كانیس أنثوس و كانیسلوبوس یعود إ لى 1917 سنة، في حین أنھ بین كانیس أنثوس و كانیس أوریوس قدر بأكثر من 3100 سنة . ا لکلمات ا لمفتاحیة : کانیس أنثوس، کانیس أوریوس، ا لبیئة ا لغذائیة، ا لسلوكات، ا لتنوع .ا لوراثي، ا لحمض ا لنووي، میكروساتلیت، تلمسان، ا لجزائر Abstract Eco-ethology and genetic diversity of the African golden wolf (Canis anthus) in Algeria This thesis aims to provide new knowledge on the trophic ecology, behavior and social organization as well as the genetic diversity of a recently described canid species, the African golden wolf (Canis anthus). The study of the diet composition was carried out in the Tlemcen hunting reserve by the analysis of 246 scats collected during an annual cycle. The results showed the generalist and opportunistic character of this canid with a clear tendency of predation towards large prey which cover a biomass of 65.32%. Wild boar (Sus scrofa) is the most consumed prey with a frequency of occurrence of 28.05% and a biomass of 41.51%. Domestic animals, especially sheep, occupy an occasional part but relatively important in the food spectrum, which exposed the species to a systematic persecution by hunters and local residents. Other foods such as fruits and vegetables, reptiles, insects, birds and organic waste are consumed in small amounts to complete its diet. The African golden wolf lives in a territorial groups of which three were determined inside the reserve and four outside. The size of its groups varies from five to eight adult individuals with an estimated density of 1.98 groups/10km2. The species shares its territory with other sympatric species in particular the Striped hyena (Hyeana hyeana) as indicated by many cases of overmarking observed throughout the year. Genetic analysis of 51 samples of tissue, hairs and scat samples confirmed the existence of the African golden wolf in Algeria and the absence of the Golden jackal (Canis aureus). It also showed a very high genetic diversity for either the mtDNA control region fragment, which resulted in 17 haplotypes or for microsatellite genotyping (Ho = 0.7, He = 0.81), Which revealed the existence of five populations in the northern part of Algeria with presence of gene flow. The molecular clock approach applied for mtDNA fragment (342 bp) of three canid species showed that the most recent common ancestor between C. anthus and C. lupus dates from 1917 years ago, whereas that between C. anthus and C. aureus is more than 3100 years ago. Key words : Canis anthus, Canis aureus, trophic ecology, ethology, genetic diversity, mtDNA, microsatellites, Tlemcen, Algeria.