Segmentation du plan osseux des IRM du genou

Abstract

Ce travail se positionne dans le contexte de la pédagogie médicale pour l’apprentissage de l’anatomie humaine mais également dans le contexte de l’aide au diagnostic. Les objectifs visés au départ étaient la reconstruction 3D du genou après segmentation de l’ensemble de ses constituants tissulaires (os, muscle, ligament,) à travers toutes les coupes. Les contraintes de temps et de moyens nous ont poussés à nous limiter à la segmentation des structures osseuses. Nous avons travaillé avec des images IRM de 4 patients, 3 cas pathologiques et un cas sain. Nous avons développé, sous Matlab, un algorithme de traitement d’image du genou, en passant par les étapes de prétraitement puis de segmentation par une classification non supervisé (k-means) et par une segmentation par seuillage puis d’extraction de caractéristique (mesure de périmètre des différents os). Nous proposons une interface graphique avec choix des paramètres (seuil,…) dont l’algorithme a besoin pour s’adapter aux différentes images. En perspectives lorsque l’utilisateur aura segmenté l’ensemble des coupes, une reconstruction 3D sera possible. Ce qui permettra la visualisation précise du genou d’un patient. Ainsi nous aurons aidé le médecin dans son diagnostic et il sera également possible de simuler certains actes chirurgicaux.