Alignement et recherche des séquences génétiques

Abstract

L’information génétique fait le sujet du jour pour la recherche. Des centaines d’organisation autour du monde font la récolte de ces données essentiellement représentées par les séquences biologiques (bases nucléiques de l’ADN et acides aminés des protéines). Le volume de ces données ne cesse de croitre alors il faut faire appel aux techniques bioinformatiques. La recherche dans ces banques est basée sur l’alignement et le calcule de score pour obtenir des résultats biologiquement significatifs, qui peuvent être contenues dans des segments alignés entre séquences. Notre projet de Master consiste à concevoir et implémenter un outil pour faire la comparaison de séquences (Dot Plot, algorithmes d’alignement global et local), la lecture des séquences au format FASTA, la transcription et la traduction des séquences d’ADN.