Elaboration d’amorces pour le gène HLA DR3/DR4 lié au diabète du type 1

Abstract

Introduction. L’incidence du diabète de type 1 (DT1) dans différents groupes ethniques est extrêmement variable, suggérant l’implication aussi bien de déterminants génétique que d’éléments de l’environnement. Des études précédentes sont montré que des sujets caucasiens hétérozygotes DR3/DR4 ont 50 fois plus de risques de développer un diabète par rapport à la population générale. Compte tenu des statistiques élevées du DT1 en Algérie et l'absence d’études d’associations génétiques chez cette même population le but de cette étude est de concevoir des amorces spécifiques encadrant les transcrits des gènes HLA DR3 et DR4 afin d’évaluer, par la suite, le risque conféré par ces allèles sur l'apparition du DT1 dans la population Algérienne au cours d’études ultérieures de type cas-témoins ou des études de familles. Matériel et méthodes. Les séquences génomiques et des transcrits des gènes HLA-DR3 et HLA-DR4 ont été obtenu grâce à la base de donnée Ensembl. Le logiciel Primer-Blast a été utilisé pour concevoir des amorces spécifiques encadrant une partie de chaque transcrit. Résultats. Dans un premier temps, des amorces aspécifiques ont été obtenus, ce qui nous a obligés à changer la séquence à amplifier. Les amorces obtenues sont spécifiques des transcrits des gènes HLA DR3 et DR4 et présent des caractéristiques optimales pour le bon déroulement d’une PCR classique ou une RT-qPCR. I