Analyse structurale et fonctionnelle des pannexines

Abstract

Les pannexines (Panx) sont des protéines membranaires intégrales à passage transmembranaire multiple. Elles font partie d’une famille multigénique de trois membres (Panx1, Panx2, Panx3) présent chez plusieurs organismes comme l’homme, souris et le rat. Elles forment des hémicanaux permettant le passage de molécules comme l’ATP dans le milieu extracellulaire. Pour ce travail nous avons fait une analyse structurale et fonctionnelle des pannexines au moyen d’outils informatiques. Pour cela, nous avons utilisé les séquences des pannexines humaines (hPanx) afin de prédire et caractériser pour la première fois les différents domaines des trois pannexines (hPanx1, hPanx2, hPanx3). Nous avons poursuivi ce travail par l’étude des résidus fonctionnels qui se trouvent dans différents domaines par l’étude de la prédiction des modifications post-traductionnelles que peuvent subir ces pannexines. L’étude de la topologie qui a été réalisée au moyen des trois programmes ProtScale, ΔG Predictor et TOPCONS a révélé que les trois pannexines humaines sont des protéines membranaires à quatre passages transmembranaires (M1, M2, M3, M4) exposant deux boucles extracytoplasmiques (EL1, EL2) et une boucle intracytoplasmique (IL). Les extrémités N- et C-terminales sont exposées du côté cytoplasmique. Ce travail a montré également la présence d’un cinquième domaine transmembranaire éventuel au niveau de la hPanx1 et de la hPanx3. Les résultats de l’étude des modifications post-traductionnelles ont montré que les trois pannexines humaines semblent contenir des sites potentiels de N-glycosylation, palmitoylation, phosphorylation, protéolyse et ubiquitinylation à l’exception de la hPanx1 qui semble ne contenir aucun site de palmitoylation