Effet de la delta-tocophérol sur la topoisomérase II lors du cancer : Simulation par docking moléculaire

Abstract

Le cancer est une maladie caractérisée par une prolifération cellulaire incontrôlée au sein d'un tissu normal de l'organisme. Cependant, Il a été prouvé que les cellules tumorales présentent un dysfonctionnement de la protéine topoisomérases de type II, responsable du contrôle de la topologie de l'ADN au cours des processus vitaux tels que la réparation et la réplication. Par ailleurs, plusieurs études ont suggéré l'effet anticancéreux de la vitamine E et des γ- et δ- tocophérols. Dans cette étude, nous avons réalisé un docking moléculaire sur l’effet inhibiteur du delta-tocophérol sur la protéine topoisomérase de type II. Les protéines et les ligands utilisés ont été téléchargés à partir des banques des données PDB et PubChem. La modélisation et la minimisation de l’énergie du δ- tocophérol a été réalisé par Chem 3D. Le docking moléculaire a été effectué par le programme ArgusLab et les interactions entre le delta-tocophérol et La topoisomérases de type II ont été visualisés par Discovery studio. Les résultats de la simulation ont montré que le delta tocophérol à une forte affinité pour la topoisomérase avec une énergie de liaison très faible, interprété par des interactions hydrogène classique et des interactions Alkyl hydrophobiques. Le delta tocophérol pourrait être utilisé comme un inhibiteur de la protéine topoisomérase de type II lors du cancer. Mots clés : topoisomérase II, δ-tocophérol, docking moléculaire, inhibiteur, cancer.