Étude in silico des interactions moléculaires enzyme-inhibiteur : cas de la lipase pancréatique humaine

Abstract

Résumé Les lipases ou triacylglycérol acyl-hydrolases (EC 3.1.1.3) sont des α/β-hydrolases d’esters du glycérol, qui jouent un rôle clé dans le métabolisme des lipides. Dans ce travail nous nous sommes intéressés à l’inhibition de la lipase pancréatique humaine qui hydrolyse les lipides alimentaires dans le système digestif, en transformant le triacylglycérol présents dans les huiles ingérées en monoglycérides et en acides gras libres. Cette inhibition réduit la digestion et l’absorption des lipides ainsi que l’accumulation des tissus adipeux, cela permet de contrôler et de traité l’obésité. La présente étude a pour objectif d’étudier in silico les interactions moléculaire de dix potentiels inhibiteurs d’origine naturelle avec la lipase pancréatique humaine. Pour cela, trois principaux logiciels ont été utilisés ; AutoDock Vina pour effectuer le docking moléculaire, Discovery Studio Visualizer pour visualiser les interactions moléculaires, et SwissADME pour prédire la biodisponibilité par voie orale des composés testés. L’analyse de nos résultats a monté que parmi les dix inhibiteurs testés, seulement l’alisol B et l’alisol C, dérivés de la plante Alisma orientale, sont prédit comme de bon inhibiteurs de la lipase pancréatique humaine en raison de l’absence des effets indésirable probable. Mots clés : Lipase pancréatique humaine, inhibiteurs, docking moléculaire Abstract Lipases or triacylglycerol acyl hydrolases (EC 3.1.1.3) are α/β-glycerol ester hydrolases, which play a key role in lipid metabolism. In this study, we focused on the inhibition of human pancreatic lipase, which hydrolyses dietary lipids in the digestive system, converting triacylglycerol present in ingested oils into monoglycerides and free fatty acids. This inhibition reduces lipid digestion and absorption as well as the accumulation of adipose tissue, thereby controlling and treating obesity. The current in silico study aims to investigate the molecular interactions of ten potential naturally occurring inhibitors with the human pancreatic lipase. For this purpose, three main software packages are used, AutoDock Vina to perform the molecular docking, Discovery Studio Visualizer to visualise the molecular interactions, SwissADME to predict the oral bioavailability of the tested compounds. The analysis of our results showed that among the ten inhibitors tested; only alisol B and alisol C derived from the plant Alisma orientale predicted to be good inhibitors due to the absence of probable adverse effects. Key Words: Human pancreatic lipase, inhibitors, molecular docking مــــــــ صـخـل الليباز أو ثلاثي الجلسرين أسيل هيدرولاز (3.1.1.3 EC (هي عبارة عن α/ β هيدرولاز، والتي تلعب دورا رئيسيا في التمثيل الغذائي للدهون. في هذه الدراسة، ركز� على تثبيط ليباز البنكر�س البشري، الذي يحلل الدهون الغذائية في الجهاز الهضمي، ويحول ثلاثي الجلسرين الموجود في الزيوت المبتلعة إلى أحادي الجليسريد وأحماض دهنية حرة. يقلل هذا التثبيط من هضم الدهون وامتصاصها وكذلك من تراكم الأنسجة الدهنية، وابلتالي التحكم في السمنة وعلاجها. الهدف من هذه الدراسة هو التحقيق في التفاعلات الجزيئية لعشرة مثبطات طبيعية محتملة مع ليباز البنكر�س البشري. لهذا الغرض، تم استخدام ثلاثة برامج رئيسية، Vina AutoDock لأداء الالتحام الجزيئي، Studio Discovery Visualizer ل رؤية التفاعلات الجزيئية، SwissADME للتنبؤ ابلتوافر الحيوي عن طريق الفم للمثبطات التي تم اختبارها. أظهر اتح ت ليل نتائجنا أنه من بين العشرة المثبطات التي تم اختبارها، فقط B alisol و alisol C المسخرج من النبتة Orienale Alisma م توقع أن تكون مثبطات جيدة بسبب غياب الآاثر جانبية محتملة. الكلمات المفتاحية: ليباز البنكر�س البشري، مثبط ، ات الإلتحام الجزيئي.