Elaboration d’amorces pour le gène de la Glutathion peroxydas 3 GPx3

Abstract

La glutathion peroxydase GPX constitue le système enzymatique anti-oxydant principal. Elle catalyse la réduction d’une grande variété d’hydroperoxydes tels les hydroperoxy des d’acides gras et le peroxyde d’hydrogène, par l’intermédiaire du glutathion et protège ainsi les cellules des mammifères contre le stress oxydatif, parmi les glutathions peroxydases on retrouve le gène GPX3 localisé dans la région q32 du chromosome 5 Dans ce travail nous allons concevoir, avec spécificité un couple d'amorce encadrant le rs8177404 du gène GPX3 afin de pouvoir réaliser par la suite, des études d’association génétique impliquant le polymorphisme rs8177404. L’utilisation de l’outil Primer3 nous a permis d’obtenir un couple d’amorces d’une longueur de 20 nucléotides, qui encadre la région d’intérêt, et qui donne un produit d’amplification de 243pb. La PCR in-Silico, réalisée grâce à l’outil UCSC, nous a permis de confirmer les résultats obtenus. Ce travail représente une étude préalable et indispensable à toute analyse de biologie moléculaire, qui a pour but d’étudier l’implication d’un polymorphisme génétique dans la survenue d’une pathologie associée. Mots clés : Gène GPX3, rs 8177404, amorce Summary Glutathione peroxidase GPX is the main antioxidant enzyme system. It catalyses the reduction of a wide variety of hydroperoxides such as fatty acid hydroperoxides and hydrogen peroxide, via glutathione and thus protects mammalian cells against oxidative stress, among the glutathione peroxidases, we finds the GPX3 gene, localized in q32 region of chromosome 5 In this work we will design, with specificity, a pair of primers framing the rs8177404 of the gene GPX3 in order to be able to realize thereafter, genetic association studies involving the polymorphism rs8177404. The use of the Primer3 tool allowed us to obtain a pair of primers with a length of 20 nucleotides, which frames the region of interest, and which gives a 243 bp amplification product. The in-Silico PCR, carried out using the UCSC tool, enabled us to confirm the results obtained. This work represents a preliminary study and indispensable step to any analysis of molecular biology, which aims to study the implication of a genetic polymorphism in the occurrence of an associated pathology. Key words: GPX3 gene, rs 8177404, primer ملخص اىديىتبث ىٍ ب شٍومس ذٍاص هى ظّب إ ضّ ضٌٌٍبد ىلأمسذة اىشئ سٍ تٍ. هى حٌفض ىيحذ دٍ ىَعت تٍ ىْعت GPX3 وب شٍومس ذٍ اىه ذٍسوخ بفضو اىديىتبث ىٍ ،ُ حٌ خلا بٌ hydroperoxy ثٍو الأح بَض اىذه تٍْ hydroperoxides . مشو ىٍصو 5 Q ف اى طَْقت 32 GPX اىثذ بٌٍث ضذ الامسذة. و ب ب شٍومس ذٍاص اىديىتبث ىٍ تىخذ اىد بٍْث 3 rs ف هزا اىع وَ سىف قّى بتص صوج عٍ 8177404 . rs أخو تحق قٍ بعذ رىل اىذساسبث اىىساث تٍ اى شَتشمت و اىت ت طْىي عيى بىى ىٍَغف ضٍ 8177404 س حَ ى بْ. ببىحصىه عيى بضع )آ ىٍسط( بطىه 02 اى ىٍْمي ىٍت ذٍاث اىت تقع عيى حذود اى طَْقت Primer استخذا أداة 3 ببىتأمذ اى تْبئح. UCSC داخو اىس يٍ نٍى، اى حَقق خلاه أداة PCR و نٍ بْْ .pb اى ذَسوست ، و عٌط اى تَْح 042 هزا اىع وَ ثٌَو لأوه شٍة، لا غ ىْ ع هْب لأ تٌ دساست تحي وٍ اىب ىٍىىخ بٍ اىدض ئٌ تٍ، اىزي هٌذف إىى دساست إششاك تعذد الأشنبه اىد ف بذا تٌ حبىت الأ شٍاض اى شَتبطت بهب قطعت , rs اىد بٍْث 8177404 . GPX اىني بَث اى فَتبح تٍ 3